В його фондах зберігаються археологічні пам’ятки, реліквії запорізького козацтва, стародруки ХVI-ХVП ст., раритетні видання ХVІІІ- п. ХХ ст., культова колекція, порцеляна, годинники, меблі, зброя і багато інших пам’ятників історії і культури. Гордістю музею є найбільша в Україні колекція кам’яних баб. 102 статуї, серед яких експонати, аналогів яким немає в жодному європейському музеї.